Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms