Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms