Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD12Q8N8I0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms