Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBR7Q8N806 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms