Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM199Q8N511 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM199Q8N511 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms