Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC47Q8N1G4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC47Q8N1G4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms