Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NME9Q86XW9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms