Protein–RNA interactions for Protein: Q86VL8

SLC47A2, Multidrug and toxin extrusion protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A2Q86VL8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC47A2Q86VL8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC47A2Q86VL8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms