Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPM2Q86SE8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM2Q86SE8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM2Q86SE8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM2Q86SE8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM2Q86SE8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM2Q86SE8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM2Q86SE8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM2Q86SE8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM2Q86SE8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms