Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP6Q7Z6E9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP6Q7Z6E9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms