Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAPQ7Z569 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms