Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMC4Q7Z404 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC4Q7Z404 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms