Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT27Q7Z3Y8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms