Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms