Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP1Q7L576 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms