Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms