Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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