Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM179Q6ZVK1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM179Q6ZVK1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM179Q6ZVK1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM179Q6ZVK1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM179Q6ZVK1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM179Q6ZVK1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM179Q6ZVK1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM179Q6ZVK1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM179Q6ZVK1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM179Q6ZVK1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM179Q6ZVK1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM179Q6ZVK1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms