Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRCAPQ6ZRS2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRCAPQ6ZRS2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRCAPQ6ZRS2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms