Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM72Q6ZMU5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms