Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A1Q6PCB7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms