Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFXN4Q6P4A7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms