Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFSP1Q6NVU6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms