Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NANOGP8Q6NSW7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms