Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms