Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL3Q6DD88 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms