Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUSD4Q5VX71 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SUSD4Q5VX71 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUSD4Q5VX71 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUSD4Q5VX71 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUSD4Q5VX71 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUSD4Q5VX71 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUSD4Q5VX71 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SUSD4Q5VX71 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms