Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLIPQ5VWP3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLIPQ5VWP3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms