Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF4Q5VUM1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms