Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DIPQ5VU43 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms