Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms