Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HES3Q5TGS1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms