Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms