Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMPD3Q5JV73 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms