Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB2Q5IJ48 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB2Q5IJ48 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB2Q5IJ48 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB2Q5IJ48 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB2Q5IJ48 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRB2Q5IJ48 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms