Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms