Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms