Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFNL1Q499Z3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFNL1Q499Z3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFNL1Q499Z3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFNL1Q499Z3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFNL1Q499Z3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFNL1Q499Z3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms