Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TTLL9Q3SXZ7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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