Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSM12Q3MHD2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms