Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRFIP1Q32MZ4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms