Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4BQ2VIQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms