Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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