Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms