Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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NDUFA9Q16795 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA9Q16795 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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NDUFA9Q16795 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDUFA9Q16795 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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