Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYPL1Q16563 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYPL1Q16563 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYPL1Q16563 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYPL1Q16563 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYPL1Q16563 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYPL1Q16563 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYPL1Q16563 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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