Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SSX1Q16384 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SSX1Q16384 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX1Q16384 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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