Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC6Q16204 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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