Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CST6Q15828 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CST6Q15828 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CST6Q15828 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CST6Q15828 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CST6Q15828 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CST6Q15828 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CST6Q15828 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CST6Q15828 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST6Q15828 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST6Q15828 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST6Q15828 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST6Q15828 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CST6Q15828 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CST6Q15828 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CST6Q15828 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CST6Q15828 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CST6Q15828 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms