Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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